清标分为以下六个步骤：
1、投标函核对
查看招标文件相关内容，核对投标单位的回标信息是否满足要求，具体内容包括投标总价、工期、工程质量等，对于不符合要求的予以提示，并要求投标单位澄清。
2、经济标列表，检查算术性错误
在工程量清单及参考价（或控制价、标底等）的基础上，将各投标单位的经济标横向依次排列，包括分部分项清单、措施项目清单、其他项目清单等。
在检查算术性错误时，可以用原清单工程量乘以投标综合单价得出每项清单的合价，并与该项投标报价进行比较，如果不一致，说明出现了算术性错误，需要提示投标单位在下次回标时予以修正。
3、数据链接，检查链接性错误
将上述清单明细表与清标模板中的各类汇总表进行链接，做出投标总价对比表，并以此检查是否存在链接性错误。同样，如果出现链接性错误，需要提示投标单位在下次回标时予以修正。
4、单价比对，标明高低
根据参考价（即市场价）或者对标项目价格判断各投标单位的价格高低，重点对投标报价影响大的内容进行分析，看其是否明显偏离市场价格。
对于总包来讲，重点内容包括人工单价、钢筋、混凝土、电缆电线的材料价、模板、地面找平、墙面天棚抹灰的直接费等。这样一方面可以防止投标单位采用不平衡报价策略进行投标，另一方面可以建议投标单位在下次回标时给予更加优惠的报价。除此之外，还可以单独分析综合取费费率（管理费、利润）、主要措施项目等，并对上述明显偏离市场价格的内容予以标明。
5、总价比对，分析偏离程度
接下来，需要做总价偏离程度分析。有的需计算各投标总价与参考价之间的偏离百分比；有的需计算其余各投标总价与最低报价之间的偏离百分比；有的在去掉最高和最低报价后，将其余报价求平均值，然后计算各投标报价与平均值的偏离百分比。
不管从何种角度分析，都需要满足招标文件的评标办法及甲方具体要求。通过分析，按商务标由低到高进行排序，结合技术标、资信标评分，确定意向单位，明确谈判策略。
6、书写清标问卷、清标报告
清标工作的成果文件通常由清标分析表、清标问卷、清标报告三部分组成。在完成清标分析表后，将清标过程中的问题以问卷的形式呈现，要求投标单位澄清，并在下次回标时修正（如果有二次回标）。
例如：投标中未报价的内容是综合考虑报价后让利，还是忘记报价；同一内容不同单价或者不合理报价等需要投标单位在清标问卷中予以澄清。
清标报告则是对清标工作做出的整体总结，并提供可实施的评标建议。
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