液相色谱仪应用于痕量分析
痕量分析主要应用于地球化学、材料科学、生物医学、环境科学、表面科学以及罪证分析等领域，痕量分析是样品中待测组分含量低于百万分之一的分析方法，对于检测方法的要求高。
痕量一词的含义随着痕量分析技术的发展而有所变化,痕量分析包括测定痕量元素在试样中的总浓度，和用探针技术测定痕量元素在试样中或试样表面的分布状况,由于被测元素在样品中含量很低、分布很不均匀，特别是环境样品，往往随时间、空间变化波动很大，要充分注意取样的代表性和保证一定的样品量,为了增强对痕量成分的检出能力和除去基本干扰，痕量组分的分离与富集常常是的。
液相色谱仪应用于痕量分析
痕量分析常用的分离 ,富集方法有挥发 ,沉淀和共沉淀 ,电解,液-液萃取,离子交换,色谱,萃取色谱,电泳等,在分离、富集过程中对于污染和痕量组分的损失要予以充分注意。液相色谱仪应用于复杂基质中痕量成分的定量分析，复杂微量组分的分离、纯化、制备，多用于环境、食品安全、药代动力学等方面。
液相色谱柱具有高柱效并且流动相可以控制和改善分离过程的选择性因此高效液相色谱仪不仅可以分析不同类型的有机化合物及其同分异构体还可以分析在性质上极为相似的旋光异构体并已在高疗效的合成药物和升华药物的生产控制分析中发挥了重要作用。