细胞培养是一项无菌操作技术，要求其操作环境和条件都要做到无菌化、无害化。为防止微生物污染及有害因素的影响，要求工作环境干净、空气清新、干爽、无烟。这是这一类实验室设计的最基本原则。细胞室的设计原则一般是在室内内部设置无菌操作区域，走动较少，常规操作和封闭式培养于一室，为100,000级洁净环境。并且清洗消毒工作设置在清洁的室外，避免物品污染干净的室内环境。
1、超净工作台/生物安全柜
在细胞培养中需要有严格的无菌环境，进行细胞操作试验时，也对空气有着极高的要求，那么，我们必须购买超净工作台或者生物安全柜，才能提供百级洁净度。
在大多数试验中，超净台已能完全满足试验者的操作要求。关于具体尺寸，要看实验室的大小和人员的多少而定，规格是单人还是双人，型号是单面还是双面，以及具体的购买数量等，都要有详细的规划。
若试验运行存在生物风险，则应选择比超净台更为先进的生物安全柜。它与超净工作台在使用方面差别不大，但安全柜对人有保护作用，适用于对人体有危害的病毒、细胞细菌等实验。要注意的是，超净台或安全柜的放置应避免室内空气受到影响，如房门、空调等。
2、 倒置显微镜
由于细胞培养器皿厚度大，常规正镜焦场不够充分，因而不能观察到粘于培养器底的细胞，此时需用倒置显微镜进行辅助。为了进行某些荧光免疫细胞试验(IF)，则需购买反向荧光显微镜。
3、 纯水机/超纯水机
细胞培养离不开超纯水系统，普通的纯水和蒸馏水无法满足需要，必须用到超纯水。超纯水的作用是培养基和试剂，进水来源有两种，即自来水和二级纯水(质量好的去离子水，电阻10兆欧左右)。除此之外，细胞培养对于内毒素要求严格，因此超纯水机的超滤组件是必须要考虑的，应谨慎选择。
在细胞培养实验室中，需要用到的设备非常多，超净工作台或者生物安全柜、倒置显微镜、纯水机都是最基本的配置，对于这些基本配置，我们的选择更应该谨慎再谨慎。