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陈根:Nsp13,开发新冠特效药的关键分子?

放大字体  缩小字体 发布日期:2022-01-18 19:13:28

文/陈根

当前,奥密克戎依然在全球范围内流行。相较于此前流行的疫苗,虽然奥密克戎具有相对低危害性,但却具有高传染性。随着疫情防控难度加大,新冠病毒流行正在成为一种新常态,临床对于新冠治疗药物的需求也进一步提升。疫苗叠加治疗药物,成为新冠病毒防治新策略。

事实上,仅从流感流行百年史来看,疫苗加上特效药都是流感重要防治手段。自1918年至今,全球共计出现5次流感大流行,传播的流感病毒亚型依次为H1N1、H2N2及H3H2等。流感疫苗是第一道防线,但对于季节性流感而言,如果接种的疫苗毒株与传播的流感类型不完全匹配,疫苗的有效性就会大打折扣。

1999年,由吉列德与罗氏合作开发的奥司他韦获FDA批准上市,作为特效药成为疫苗之外抗击流感的重要手段。由于靶向流感病毒的高度保守位点,奥司他韦对由H5N1、H9N2等亚型流感病毒有防治作用。因为适用于多种流感病毒血清型,以及临床疗效显著等原因,奥司他韦成为流感之战中的中坚力量。

现在,新冠药物的开发也面临着类似的处境,相比疫苗防护,新冠药物治疗作为一个及时有放、能快速发挥抗病毒能力的治疗手段,可以新冠肺炎的防治中,与疫苗预防形成有效补充。

在新冠疫情长期化的可能性下,新冠药物治疗是抵抗疫情的最后一道防线。当前,许多针对COVID-19的治疗方法都集中在病毒用来与人体细胞结合的刺突蛋白上。虽然这些治疗方法对原始毒株很有效,但对未来的变异毒株可能不那么有效。

现在,芝加哥大学普利兹克分子工程学院的 Juan de Pablo 教授和他的小组利用先进的计算模拟来研究另一种蛋白质,这种蛋白质对病毒的复制至关重要,并且在不同的冠状病毒中保持相对一致,有望成为治疗新冠肺炎的关键分子。

这种蛋白质被称为Nsp13,属于一类被称为解旋酶的酶,Nsp13能够将双链DNA解开成两条单链,而这正是病毒复制的一个关键步骤。此前,研究人员知道Nsp13进行这种解旋,但对这一过程的复杂动态没有很好的了解。模拟显示了该蛋白内的多个结构域是如何相互沟通并协同作用以施加正确的力量进行解旋的。

此外,研究人员还发现,当外部分子与蛋白质的某些部位结合时,就会破坏这个“通信网络”。这意味着该蛋白不能再有效地解开DNA,病毒的复制变得更加困难。

并且,对Bananin、SSYA10-001和chromone-4c三种化合物的测试显示,这三种化合物似乎都能通过与某些位点结合并破坏蛋白质的网络而有效地破坏Nsp13蛋白质。研究人员认为,鉴于不同冠状病毒变体的解旋酶序列的一致性,这些抑制剂可以作为设计针对解旋酶的药物以治疗COVID-19的宝贵起点。

 
(文/小编)
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