紫菜的种类较多，但种问杂交研究却较少，而且目前也几乎没有在生产中应用的杂交种。其原因主要有两个：一是多数栽培种类的紫菜叶状体力雌雄问体，在杂交的过程中必须避免自体受精，与海带等杂交相比有一定的难度;二是紫菜叶状体的核相是单相的， 一些遗传的优良性状难以通过杂交表现出来。因此，国内外普遍采用选择育种的方法进行紫菜育种。目前进行人规模生产的新品种主要有大叶甘紫菜、奈良轮条斑紫菜、长叶形条斑紫菜等。
(一)大叶甘紫菜
1962年日本爱援县西条市的玉律渔业协会的渔民从甘紫菜群体中经多次选育，培育出的紫菜新品种，其持点是藻体大而薄、体形纫长、皱折多而浅呈青绿色，长度为如—120cm。该品种具有出苗早，生长速度快，抗白腐病能力强，单袍子故散量大等优点，适宜在内湾和河口附近海区栽培，产量较高。缺点是果袍子囊数量少，采果孢子比较困难。
(二)奈良轮条斑紫菜
1965年日本干叶县奈良轮渔业协会的渔民从条斑紫菜中选择的长叶形个体经筛选、分离培育而成，是条斑紫菜的一个变种。其藻休细长呈倒披针形、茶红色皱折多而深.长度40—60M，具有出苗早，幼苗期单袍子放散数量大，抗病能力强，产品质量好等优点，适宜在外悔区栽培，产量较高。缺点是果孢子形成的数量少。
(三)长叶形条斑紫菜
是我国江苏省启东县从条斑紫菜群体中选择出的长叶个体，经过自交培育出的新品种。该品种藻体细长形，具有生长速度快，产量高，果孢子囊形成面积小，质量好的优点，经推广可提高产量10%以上。
以上这三种紫菜各有特点，育种方法也不同，大家可以根据自己的实际情况来选择育种方式。
