医院污水主要来自妇产科、妇幼保健、常规治疗的医务工作人员及病人的正常生活用水，医疗用具消毒、清洁用水以及医护人员生活区的生活污水，其水质除与普通生活污水相似外，还含有大量病原性微生物，如细菌、病毒、寄生虫卵、原虫等，以及重金属（化验室、放射科等污水），消毒剂如酚、洗衣房的直链烷基苯磺酸盐（LAS）等有毒、有害的有机和无机化合物。放射性废水（放射性诊断治疗过程排出的含有放射性同位素的废水）是致癌、致畸、致突变物质、CODcr、BOD5、NH3-N、SS等，对环境危害大，若不加以处理，这些物质排入水体将对环境造成巨大的危害并长期危害人体健康，甚至引起传染病的爆发流行。
医疗废水的性质是指含有病原体、重金属、消毒剂、有机溶剂、酸、碱酸、碱、放射性污水，被粪便、传染性细菌、病毒等病原微生物污染，具有传染性，可诱发疾病或对人体造成伤害。医疗废水来源和成分复杂，包括病原微生物、有毒有害物理化学污染物和放射性污染，具有空间污染、急性感染和潜在感染的特点，未经有效处理将成为传播疾病的重要途径和严重污染环境。
污水处理步骤按如下步骤处理污水：
(1)、医疗污水通过格栅过滤、集水井沉降，固液分离，液相污水进入水解酸化池，利用水解产酸菌的作用,将污水中不溶性有机物水解成可溶性有机物, 使大分子有机物质分解成小分子有机物质 ,并去除部分可溶性有机物, 提高污水的可生化性，为后序快速降解有机物创造有利条件;
(2)、水解酸化后的污水依序进入贫氧池、接触氧化池、二次沉降池循环，使废水处于缺氧、富氧循环变换的环境中，实现如下
-脱氮;将有机氮转化为氨氮，通过好氧微生物硝化菌作用将氨氮转化为亚硝态氮、硝态氮，再通过厌氧微生物反硝化菌将亚硝态氮、硝态氮转化为氮气，从污水中逸出;
-除磷;利用聚磷菌在缺氧环境中释磷，而在富氧环境中过量吸磷的特性，形成高含磷量的污泥;
-彻底降解有机物;在水解酸化的基础上，利用好氧微生物富氧环境中快速繁殖的特性，厌氧微生物在缺氧环境中快速繁殖的特性，轮番降解有机物，将其转化为污泥;
(3)、对污水消毒，使之达到排放标准;
(4)、定期清除污泥。
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