心肌炎的患者大部分不会遗留后遗症，但是部分患者有可能有后遗症。普通急性心肌炎大部分预后良好，约50%的急性心肌炎病例在2到4周恢复，也有少部分患者病情可长期迁延，而成为慢性或持续性心肌炎或心肌病改变。
爆发性心肌病，急性期病死率高达80%，但一旦度过急性期，长期预后良好。暴发性心肌炎患者在急性期可出现心力衰竭，严重心律失常，心源性休克，多脏器功能不全，甚至死亡。心肌炎患者，需要养成良好的生活习惯，作息规律，适当锻炼，以提高机体的免疫力。
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