临床上很少通过打干扰素来提高免疫力。干扰素具有抗病毒，抗肿瘤作用，对于体液免疫，细胞免疫均有免疫调节作用，对于巨噬细胞也有一定的免疫增强作用。但其毒副作用却是普遍存在的，因此很少用于提高免疫力治疗。
最常见的副作用，主要是发热及流感样综合征，体重减轻，脱发，情绪激动，骨髓抑制，导致血红细胞血小板减少，偶发神经系统损伤，影响内分泌系统功能。
临床上主要使用干扰素抗病毒治疗，在控制病毒感染，阻止病毒在体内扩散，促进疾病的痊愈等方面起到了非常重要的作用。比如慢性丙型病毒性肝炎时，使用干扰素治疗有较好的临床疗效。
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