商贷还清后，不能就同一套住房再申请公积金贷款，但能办理商贷转公积金贷款，或者以家庭第二套住房重新申请公积金贷款，只要能满足相应的公积金贷款条件就行。
转公积金贷款的注意事项1、同一套住房商贷转公积金贷款
同一套住房已经办理了商贷的，无法再办理公积金贷款。公积金贷款只适用于住房按揭贷款，即为购买住房而发放的贷款，而商贷还清后再申贷就是房产抵押贷款，因此同一套住房，商贷还清后不能公积金贷款了。
想要使用公积金贷款，只能申请商贷转公积金贷款，以长沙公积金贷款为例，转贷条件有：
(1)公积金账户状态正常，且最近12个月连续正常缴存;
(2)信用良好，收入稳定，有偿还贷款本息的能力;
(3)未超过国家法定退休年龄，具备完全民事行为能力;
(4)没有未结清的公积金贷款或未终止的公积金约定提取;
(5)职工家庭购买该套住房未在长沙公积金中心和省直分中心办理过购房提取;
(6)职工及配偶均无2次以上公积金贷款记录，且现无房或仅有一套住房;
(7)具有长沙公积金中心认可的资产设定抵押，一般有产权证的就是以所购住房设定抵押;
(8)职工能自筹资金结清原商贷，且要在公积金中心审批通过后30日内结清;
(9)原按揭贷款还款情况良好，原商贷银行对提前全部还款无异议;
(10)长沙公积金中心规定的其他条件。
2、商贷还清后第二套住房公积金贷款
首套住房商业贷款还清后，第二套住房还能否公积金贷款，关键是看能否满足公积金贷款条件，公积金中心是允许职工家庭有第二套改善性住房贷款的。
公积金贷款条件与上述差不多，无非申请人年龄达标、公积金账户正常、连续缴存时间达标、征信良好、收入稳定、无2次以上公积金贷款记录、家庭房产2套以下、购房行为发生在申贷前一年内等等。
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