慢性萎缩性胃炎的临床症状主要是出现规律或者不规律的胃部消化功能异常，如腹部不适、胃胀、纳差、胃部疼痛、进食后饱胀感，也可以出现原本规律的胃部不适症状转变为不规律，甚至出现呕吐，呕吐物可以呈深褐色或者黑色，大便黑色。这些症状的出现主要与胃部功能损害直接有关，这些症状都是非特异性的与胃炎相似，患者最好到医院做胃镜检查，明确诊断。
慢性萎缩性胃炎会出现胃黏膜肠上皮化生和非典型增生有可能转变成癌，属于胃癌前病变。胃癌前病变是指容易发生癌变的胃黏膜病理组织的改变，是从良性上皮组织转变成癌过程中的交界性的病变，需要在胃镜下做病理活检明确诊断。
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