为了防止水渗透，一次性纸杯的内壁上通常涂了一层薄薄的蜡。蜡见热是会溶化的，一般情况下，如果水的温度超过了40℃，这层蜡就会溶化掉。因此，一次性纸杯最好用来装冷饮，而不要装40℃以上的热水。
一般正规工厂生产的纸杯会使用食品级的蜡来做纸杯的内壁涂膜，因此即便是水温高溶解了纸杯上的蜡，也没有安全问题。不过，现在很多不法加工厂采用成本较低的工业石蜡来做纸杯内壁的涂膜，工业石蜡中含有对人体有害的苯和多环芳烃等物质，会对人体的神经系统和造血系统有害。如果经常用劣质的一次性纸杯喝开水，必然会摄入一部分工业蜡中的有害物质。
专家建议，购买一次性纸杯要谨慎，使用一次性纸杯时，第一杯水最好不要喝，最好等四五分钟后将水倒掉，使纸杯中有害物质充分挥发。
现在，很多家庭和单位都会准备一些一次性纸杯，来了客人，一人用一个，用完了就扔，既卫生又方便。对此，专家提醒，不要用一次性纸杯喝热水。