便秘是有原因的，可以是由一些器质性的病变引起，或者是一种功能性的便秘。
以肠道疾病引起的便秘多见，可见于先天性巨结肠，炎症性肠病，外伤后期及肠粉和术后的狭窄，肿瘤及其转移所致肠狭窄，盆底失弛缓症，直肠内折叠，会阴下降，直肠前突，肛裂，痔疮，肠易激综合征等。或者是肠外的疾病引起，如脑梗死，脑萎缩，截瘫，抑郁症，厌食症，甲状腺功能低下，糖尿病，铅中毒，维生素B1缺乏，子宫内膜异位症等。
或者是患者进食量减少，食物精细，食物热量过高，蔬菜水果少，饮水少，运动少，久坐，卧床，有不良排便习惯及人际关系紧张，家庭不和睦，心情长期处于压抑状态;或者因生活规律改变，如外出旅游、住院、突发事件影响，都可导致排便规律改变而引起便秘。
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