名词包含范围不同：变色龙是蜥蜴的一种；而蜥蜴是有鳞目蜥蜴亚目内爬行动物的总称。
特征不同：变色龙具有体色随环境变化的能力；而蜥蜴中，除了变色龙与安乐蜥，其他蜥蜴无法改变体色特征。
分布地区不同：变色龙主要分布在非洲地区，少数分布在亚洲和欧洲南部，其中在马达加斯加居住的种类占一半左右；而蜥蜴在世界各地均有分布，大多分布在热带和亚热带，其生活环境多样。
栖息方式不同：变色龙主要为树栖生物；蜥蜴主要是陆栖，也有树栖、半水栖和土中穴居。
行动速度不同：变色龙的行动十分迟缓，人们用树懒来比喻它那漫不经心的样子。变色龙是主要栖息于树木的爬行动物，除了产卵和求爱外，很少光顾陆地。多数蜥蜴有四条腿，其中后肢有力，能快速奔跑并改变前进的方向。有些蜥蜴可以仅用两条长后肢就可以跑的飞快，跑动的同时也能用尾巴保持方向。王蜥的时速是所有时速中最快的，可达20到25千米/小时，即使在水面上跑也可保持在水面。
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